自二零零一年爆发登革热开始，市政署与卫生当局合作於澳门及离岛区进行卫生黑点的清理工作，由於绝大部分卫生黑点皆位於空置私人地段或空置楼宇等私人地方，本署收到相关卫生黑点的讯息後，会转介卫生局当区之卫生监督，评估卫生情况是否对周边环境之公共卫生构成威胁，若被卫生监督确认後，将要求有关之业权人或土地拥有人，於通告张贴日起至指定期限内务必作出相关清理工作。倘若有关卫生情况未有改善，该局将致函要求市政署协助，本署会尽量配合开展有关之改善工作。此外，除人力加强清理卫生黑点工作外，本署更联同卫生部门举办一系列预防登革热宣传和灭蚊活动，以唤醒居民注重其居住环境及附近的卫生情况，提高市民预防登革热的意识。

  市政署是担当一个配合及执行协助清理卫生黑点的角色，倘若在执行上遇到阻碍及困难，本署与卫生当局、相关业权人士进行协商，予以调解各方在衍生及影响环境卫生、技术方面等问题，以维护公共卫生及环境清洁，从而保障市民的生活质素。